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HI简历
蛋白结构算法
18800000000hi@hicv.cn应届生上海市
个人总结
意向岗位为蛋白结构算法。主修生物信息学、计算机科学与技术、计算生物学,熟悉PyTorch与AlphaFold类结构预测流程,能完成结构数据清洗、特征构建与模型训练。课程与项目中做过蛋白结构预测与建模实践,关注TM-score、RMSD等指标,习惯用对照实验验证改动并记录可复现结果。
教育经历
示例大学
2023年09月-2027年06月
生物信息学、计算机科学与技术、计算生物学 本科 本科
就读于示例大学,主修生物信息学、计算机科学与技术、计算生物学方向课程,涵盖数据结构、机器学习、生物信息算法与结构生物学基础。课程项目中完成蛋白结构数据处理与预测流程搭建,输出可复现实验记录与评估结果。
工作经历
示例智能生物技术公司
2025年03月-2025年06月
蛋白结构算法实习生 结构计算组
参与蛋白结构预测模型的训练数据整理与评估脚本开发,协助完成PDB子集清洗、链配对和残基级标签对齐;用PyTorch实现数据加载与损失函数模块,在组内测试集(约300条单链样本)上对比基线,局部结构指标有小幅提升。与算法研究员和生信同事协作,跟进实验记录与结果复盘,输出数据规范文档和评估报告,供后续迭代参考。
项目经历
课程项目:蛋白结构预测模型复现与改进
2024年09月-2025年01月
项目负责人
在课程项目中复现轻量级蛋白结构预测网络,负责数据管线搭建、特征工程与训练评估全流程。基于Python与PyTorch实现残基特征构建、几何注意力模块和早停策略,在课程验证集约120条蛋白链上评测,残基接触预测准确率较原始实现提升约4个百分点;整理消融实验与误差分析报告,定位侧链建模误差来源,课堂汇报获评优秀。
个人项目:蛋白结构数据清洗与评估工具
2023年10月-2024年05月
独立开发者
针对公开蛋白结构数据构建清洗与评估工具,用Python与BioPython实现链筛选、缺失残基统计和结构对齐,输出可复用的质量报告。在本地抽取的500条样本上测试,单次处理耗时较手工脚本缩短约一半;代码整理为命令行工具并撰写使用说明,用于课程作业与实验前的数据检查,显著减少无效样本进入训练流程。
社团和组织经历
学生发展中心
2023年09月-2024年06月
项目与活动负责人 学生组织
参与校内计算生物学学习小组与蛋白质结构相关课程项目协作,负责将结构预测任务拆分为数据准备、模型实现与评估三部分,维护数据与代码的版本记录,组织阶段讨论并汇总实验结论。在小组中协调成员分工与进度同步,推动项目按计划完成交付与复盘。
荣誉奖项
校级优秀学生
课程实践项目优秀成果
其他
- 技能: 熟悉PyTorch深度学习框架,能独立完成蛋白结构预测模型的数据加载、损失函数与训练评估模块实现。; 掌握PDB等结构数据的清洗、链配对与残基级标签对齐流程,能用BioPython完成结构对齐与质量统计。; 熟悉TM-score、RMSD、残基接触准确率等结构评估指标,习惯用对照实验与消融分析验证模型改动。
- 证书: CET-6
- 语言: 中文为母语,可阅读英文技术文档与论文,能撰写英文实验记录。
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